秋季湿度大，温度适宜，各种病菌、寄生虫繁衍迅速，饲料易霉变，如果管理不善，极易引起兔肠炎发生。因此，应每天消毒1次，保持兔舍清洁卫生，避免用霉变饲料饲喂，并注意消灭苍蝇、蚊子。同时，要分清病因，进行分类防治。
一、寄生虫性肠炎。主要由球虫引起，可推迟幼兔断奶时间以增加断奶重，并加喂高效抗球虫药物进行预防。
二、细菌性肠炎。主要由大肠杆菌、魏氏梭菌、巴氏杆菌等引起。预防由大肠杆菌引起的肠炎，要合理配制饲料，粗纤维比例要适宜，严禁饲喂发霉变质饲料，饮水要清洁无污染，水分多的青绿饲料应经晾晒后再饲喂；预防由魏氏梭菌引起的肠炎，应在转换饲料时，加喂一些含蛋白质高的干草来调节肠胃；预防由巴氏杆菌引起的肠炎，要做好兔舍通风换气工作，建立无特定病原体兔群是最主要的方法。治疗这类肠炎，可在每百公斤饲料中加喂0.5％的鼻肛净或其他预防呼吸道药物。
三、中毒性肠炎兔长期食用霉变饲料会引起中毒。由于毒素侵袭时间长，中毒性肠炎一般很难救治。应将中毒性肠炎与巴氏杆菌、魏氏梭菌引起的肠炎相区别。三者的共同特征是兔外阴部溃烂、招蝇。巴氏杆菌病主要以鼻炎为发病特征，魏氏梭菌病主要以腹泻为发病特征。
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